Af den grund er rotten også smittebærere af de bakterier som forekommer i kloakken, og kan derved overføre sygdomme til mennesker. I dag ved vi, at rotter er en kilde til mere end 50 forskellige alvorlige sygdomme – hvoraf nogle kan være dødelige. Den nok mest alvorlige sygdom er uden tvivl Leptospirose – som antages at smitte ca. 30 personer om året.

Eller sagt med andre ord, så er det antal som officielt registreres årligt af Statens Serum Institut. Symptomerne på Leptospirose er umiddelbart en influenzalignende tilstand, høj feber, hovedpine, muskelsmerter (særligt i læg og lænd), små blodudtrængninger under huden, og rødsprængte øjne, som efterfølgende kan gå over i multiorgansvigt (fx leversvig og nyresvigt). Andre sygdomstegn på Leptospirose er meningitis, hjertehindebetændelse.

Andre rotteoverførte sygdomme til mennesker er fx Borrelia, salmonellose, rabies, hare- og kattesyge (toxoplasma), bændelorme, rundorme og campylobacter.